Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lrrtm2Q8BGA3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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