Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc50Q810U5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc50Q810U5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc50Q810U5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc50Q810U5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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