Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem39bQ810L4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms