Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm5bQ80Y84 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5bQ80Y84 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms