Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR1

Tspan18, Tetraspanin-18, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan18Q80WR1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tspan18Q80WR1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms