Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pcsk9Q80W65 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pcsk9Q80W65 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pcsk9Q80W65 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Pcsk9Q80W65 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pcsk9Q80W65 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Pcsk9Q80W65 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Pcsk9Q80W65 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcsk9Q80W65 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms