Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc1Q80VQ1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc1Q80VQ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms