Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pnma8aQ80VM8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnma8aQ80VM8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms