Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sestd1Q80UK0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sestd1Q80UK0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms