Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp8Q80U87 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp8Q80U87 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms