Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pja2Q80U04 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms