Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf8Q80TJ7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms