Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnf1Q7TSH7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms