Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dsg1bQ7TSF1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms