Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Actn1Q7TPR4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms