Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmed3Q78IS1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tmed3Q78IS1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms