Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cspg5Q71M36 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cspg5Q71M36 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cspg5Q71M36 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cspg5Q71M36 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cspg5Q71M36 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cspg5Q71M36 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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