Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nme8Q715T0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nme8Q715T0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms