Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpv1Q704Y3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpv1Q704Y3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms