Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms