Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rpl35Q6ZWV7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl35Q6ZWV7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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