Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SpopQ6ZWS8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SpopQ6ZWS8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms