Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfflQ6ZQM0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfflQ6ZQM0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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