Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cnot1Q6ZQ08 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cnot1Q6ZQ08 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms