Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sbf1Q6ZPE2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sbf1Q6ZPE2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms