Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tfap2eQ6VUP9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms