Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms