Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc9c1Q6UJY2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms