Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nudcd1Q6PIP5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms