Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdgfrlQ6PE55 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms