Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp49Q6P9L4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp49Q6P9L4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms