Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hdac10Q6P3E7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac10Q6P3E7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms