Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrig3Q6P1C6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig3Q6P1C6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig3Q6P1C6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig3Q6P1C6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig3Q6P1C6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig3Q6P1C6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrig3Q6P1C6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms