Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gpbp1l1Q6NZP2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms