Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rprd2Q6NXI6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rprd2Q6NXI6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms