Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l2Q6KAU8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms