Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cep78Q6IRU7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms