Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CltbQ6IRU5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CltbQ6IRU5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CltbQ6IRU5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CltbQ6IRU5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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