Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt39Q6IFX4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms