Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Krt40Q6IFX3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Krt40Q6IFX3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Krt40Q6IFX3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt40Q6IFX3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms