Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt42Q6IFX2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms