Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Scaf8Q6DID3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scaf8Q6DID3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms