Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Smarca2Q6DIC0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca2Q6DIC0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms