Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzrn3Q69ZS0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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