Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Msl2Q69ZF8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Msl2Q69ZF8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Msl2Q69ZF8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Msl2Q69ZF8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Msl2Q69ZF8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Msl2Q69ZF8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Msl2Q69ZF8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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