Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Papd5Q68ED3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms