Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrp9bQ66X22 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms