Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Arhgef39Q66JY6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Arhgef39Q66JY6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Arhgef39Q66JY6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Arhgef39Q66JY6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Arhgef39Q66JY6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Arhgef39Q66JY6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Arhgef39Q66JY6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Arhgef39Q66JY6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Arhgef39Q66JY6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Arhgef39Q66JY6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms