Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ctnna3Q65CL1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ctnna3Q65CL1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms