Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim24Q64127 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Trim24Q64127 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Trim24Q64127 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim24Q64127 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim24Q64127 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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